🍠Python脑溶质扩散生理几何模型计算

关键词

Python | 命令行 | 脚本 | 体积 | 网格 | 加权 | 图像 | 几何 | 边界表面 | 分割 | 重建 | 内部体积 | 可视化 | 网格质量 | 平滑 | 生理 | 曲面 | 缺失 | 量化 | 扩散 | 浓度 | 磁共振

🏈指点迷津 | Brief

🎯要点

🎯生成体积网格:🖊从加权图像创建边界表面 | 🖊图像堆栈分割和表面重建 | 🖊生成内部体积网格 | 🖊转换网格为可视化数据格式 | 🖊重新网格化原始表面提高网格质量 | 🖊平滑表面减少非生理特征 | 🖊处理曲面相交和缺失面 | 🖊病理模型指定边界 | 🖊量化观察点 | 🖊数值计算扩散 | 🖊可视化给定时间示踪剂浓度。

🎯创建异质性:🖊灰质和白质的半球网格 | 🖊没有心室的半球网格 | 🖊两个半球创建脑网格 | 🖊分区映射到脑网格上,局部细化分区。

🎯脑溶质扩散张量:🖊提取平均扩散率和各向异性数据 | 🖊张量数据映射到加权图像。

🎯异质区各向异性扩散:🖊一维分子扩散 | 🖊三维大脑区域各向异性扩散。

🍇Python算法几何计算

该领域的应用很多:例如,在机器人技术中,这些应用用于解决可见性问题和运动规划。 类似的应用程序可用于设计地理信息系统 (GIS) 中的路线规划或搜索算法。

该类别的基本问题如下:

  • 凸包:给定空间中的一组点,找到包含它们的最小凸多面体。

  • 沃罗努图:给定空间中的一组点(种子),计算由靠近每个种子的所有点组成的区域的分区。

  • 三角剖分:用三角形划分平面,两个三角形要么不相交,要么共享一条边或一个顶点。 根据输入对象或三角形属性的约束,有不同的三角剖分。

  • 最短路径:给定空间中的一组障碍物和两个点,找到不与任何障碍物相交的点之间的最短路径。

💦凸包:

以下是某湖海岸线的多边形描述,有 7 个孔(用于岛屿)、518 个顶点和 518 个边。

💦沃罗努图:

计算一组顶点的沃罗努图可以使用模块 scipy.spatial 中的例程来完成。

  • 小点是原始种子,x 坐标在 0.450.50 之间,y 坐标在-0.40-0.35 之间。我们从原始列表 vertices_lsvor.points 访问这些值。

  • 该平面被划分为不同的区域,每个区域对应一个种子。 这些区域包含平面中最接近其种子的所有点。 每个区域接收一个索引,该索引不一定与其种子在 vor.points 列表中的索引相同。 要访问给定种子的相应区域,我们使用vor.point_region

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